טור חשן משפט, עם בית יוסף, [ונציה, שכ"ז 1567, דפוס זואן גריפו]. מהדורה שניה של בית יוסף.
הגהות ותיקונים רבים בכמה כת"י עתיקים משנות הש' והת'. חתימות בעלים עתיקות: צבי הירש ב"ר זיסקינד; משה במהור"ר ישראל מ"ץ דק"ק ראדזיץ; אליעזר בא"א הרב יעקב ז"ל איש צילץ, ועוד.
בעמוד האחרון ע"י הקולופון חתימה: "נאום נתן בן מוהר"ר שלמה שפירא זצ"ל אב"ד" ורישום פסוק מפרשת משפטים, כתובים בעצם כתב יד-קדשו של הגאון המקובל רבי נתן שפירא אב"ד קראקא בעל "מגלה עמוקות", כתה"י הושווה וזוהה עפ"י כתב היד של ספרו "מגלה עמוקות". [יתכן, שאף חלק ניכר מההגהות הן בכת"י קדשו, לא נבדקו ע"י מומחה].
הגאון הקדוש רבי נתן [נטע] שפירא (שמ"ה-שצ"ג), מגדולי גאוני דורו ומאבות תורת הקבלה בארצות אשכנז ("פה שלישי להאריז"ל"). נכדו של המהרנ"ש (רבי נתן שפירא בעל "אמרי שפר" ו"מבוא שערים"). נודע בקדושתו הרבה, וסיפורי מופת רבים על גילויי רוח הקודש נתפרסמו עליו במשך הדורות. בנו הגאון רבי שלמה אב"ד סאטנוב כותב בהקדמתו לספר "מגלה עמוקות" כי אביו זכה לגילוי אליהו, גם הג"ר אפרים זלמן מרגליות בהקדמה ל"מגלה עמוקות" דפוס לבוב מציין זאת. רבי ישעיהו באסאן במכתבו המפורסם לחכמי ונציה מונה את ה"מגלה עמוקות" בין יחידי סגולה שזכו למלאכים מגידים מן השמים. תלמידו המפורסם הוא רבי שבתי כ"ץ בעל הש"ך, רבי שלמה בן ה"מגלה עמוקות" כותב בהסכמה לספר "שפתי כהן", כי אביו "הגאון המפורסם איש האלהי מהר"ר נתן שפירא ז"ל היה משתעשע עם האלוף... מהר"ר שבתי כ"ץ... והיה לו כבן גדל וילד על ברכיו". לאחר פטירתו נתוודע בחלום לרבי שמשון מאוסטרופולי ללמדו רזי תורה, כמו שכתב רבי שמשון במכתבו: "הנה בשבועה חי עולמים ית' וית', כי בלילה הזה פרשת וארא שעבר ראיתי להגאון הגדול מוהר"ר נטע מקראקא בעל ספר מגלה עמוקות בחלומי בחזיון לילה, ואמר לי שפירוש החרוז הזה... יש לו רזין עילאין". ספריו וכתביו היו חביבים ביותר אצל גדולי הקבלה והחסידות.
רבים מגדולי הדורות ציינו את יחוסם כצאצאי בעל "מגלה עמוקות": רבי יהונתן אייבשיץ (הכותב עליו "זקני הגאון המקובל האלקי, איש אלוקים קדוש בעל מגלה עמוקות ז"ל, פה שלישי להאר"י ז"ל"), ה"כנסת יחזקאל", האדמו"ר רבי פנחס שפירא מקוריץ, האדמו"ר רבי מרדכי מנסכיז (הכותב בהסכמה למהדורת לבוב: "איש אשר רוח ד' דיבר בו... רב רבנן גאון הגאונים המפורסם הגדול בכל ערי הגולה, מרן זקני מוהר"ר נתן נטע אב"ד מק"ק קראקא והגליל, בעל המחבר ספר מגלה עמוקות"), ה"תפארת שלמה" מראדומסק, ה"חידושי הרי"ם", רבי מאיר שפירא מלובלין, ועוד רבים. (ראה חומר מצורף).
ו-מ, מג-תסב דף. (חסר שער ו-4 דף ראשונים). 34.5 ס"מ. מצב בינוני, כתמים ובלאי, דפים מנותקים. כריכת עור עתיקה, פגועה ובלויה.
מצורף אישור לזיהוי החתימה ע"י מומחה לכתבי יד [שאף הדפיס את ספר "מגלה עמוקות" מכת"י המחבר].